三個月寶寶早上起來咳嗽，白天又不咳可能是由于多種原因引起的，比如喉嚨干燥、過敏、感冒等都有可能引起。

1、喉嚨干燥：由于寶寶的年齡較小，喉嚨黏膜比較嬌嫩，容易受到刺激而產(chǎn)生咳嗽。在清晨，由于空氣濕度較低，寶寶喉嚨可能會感到干燥，從而引起咳嗽。建議在清晨起床后，給寶寶喝些溫水，以緩解喉嚨干燥。

2、過敏：寶寶在成長過程中，可能會對某些物質(zhì)過敏，如花粉、灰塵、寵物毛發(fā)等。這些物質(zhì)可能會引起寶寶呼吸道過敏，導(dǎo)致上述癥狀。懷疑寶寶過敏時，可以咨詢醫(yī)生，進行過敏原檢測，以便更好地診斷和治療，必要時可在醫(yī)生的指導(dǎo)下使用氯雷他定、苯海拉明、西替利嗪等藥物治療。

3、感冒：寶寶感冒也是引起上述癥狀的主要原因之一。感冒是由病毒感染引起的，常常伴隨著發(fā)熱、流鼻涕等癥狀。如果寶寶感冒，可以在醫(yī)生的指導(dǎo)下給寶寶服用一些兒童感冒藥，如抗病毒顆粒、板藍根、布洛芬等。

此外，還可能是咽喉炎、肺炎、鼻后滴漏綜合征等原因引起的，建議觀察寶寶的癥狀，并采取相應(yīng)的措施。如果癥狀嚴(yán)重或持續(xù)時間較長，建議及時就醫(yī)。